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隨著新一代測序儀(NGS)的技術(shù)發(fā)展,其使用范圍已擴展到de novo測序、變異、外顯子組和基因表達分析等領(lǐng)域。因為可以對應(yīng)高要求的分析處理能力,所以得以迅速普及。為了得到良好的測序結(jié)果,需要掌握NGS文庫的大小分布和濃度,因此,在使用NGS 系統(tǒng)時質(zhì)控文庫的以上信息非常重要。
到目前為止,為了確認NGS文庫的大小分布,使用瓊脂糖凝膠電泳作為主要手段。為了確認濃度,還需要配備實時熒光定量PCR儀和熒光分光光度計。從文庫制備到質(zhì)量控制的操作是一系列復(fù)雜的手工作業(yè),需要使用快速、簡便且價格低廉的控制方法。而且,隨著使用Index標簽序列可同時對多個樣品進行測序技術(shù)的成熟,進行質(zhì)量控制的文庫數(shù)量有所增加,需求會變得更多。
為解決上述需求,本文將向您介紹使用島津全自動電泳儀MCE-202 MultiNA 在NGS文庫的質(zhì)量控制應(yīng)用中,對小鼠的RNA序列進行分析的示例。
NGS流程和MultiNA文庫質(zhì)量控制的應(yīng)用范圍
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