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如何選擇內(nèi)參蛋白?

2025年02月14日 09:48:20      來源:廣州偉伯科技有限公司 >> 進(jìn)入該公司展臺      閱讀量:3

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Western Blot實驗中經(jīng)常提到的一個名稱——內(nèi)參。內(nèi)參即內(nèi)部參照,一般是指由管家基因編碼表達(dá)的蛋白,它們在各組織和細(xì)胞中的表達(dá)相對恒定,在檢測蛋白的表達(dá)水平變化時常用它來做參照物。

內(nèi)參的作用很多,其可以確保所有樣本的上樣量一致,可以作為校正蛋白樣品定量以及上樣過程中的誤差,保證實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性,也可以作為空白對照,檢測WB過程中蛋白轉(zhuǎn)膜是否以及發(fā)光顯色體系是否正常。

那么在內(nèi)參的選擇上面我們應(yīng)該注意什么呢?

(1) 根據(jù)不同的種屬,比如哺乳動物通常選擇β-actin、β-tubulin、GAPDH;植物來源實驗樣本,則可以選擇Plant actin、Rubisco等。

(2) 根據(jù)蛋白大小選擇,一般要選擇目的蛋白與內(nèi)參分子量相差至少5kD以上,才便于對結(jié)果分析。且當(dāng)研究的蛋白的分子量與內(nèi)參接近時,需要選擇分子量與目的蛋白的分子量差距比較大的蛋白。常用內(nèi)參蛋白的分子量大小見表1。

(3) 根據(jù)研究靶蛋白的定位選擇內(nèi)參,比如核蛋白內(nèi)參可以選擇Lamin B、Histone H3等。小編已經(jīng)將不同來源的蛋白對應(yīng)常用的內(nèi)參蛋白信息匯總?cè)缦卤恚?/p>

表1. 不同來源的蛋白對應(yīng)的常用的內(nèi)參蛋白

樣本類型常用的內(nèi)參蛋白分子量大小(kDa)
全細(xì)胞蛋白β-actin43
β-tubulin55
Cyclophilin A55
GAPDH37
α-actin43
α-tubulin55
Cyclophilin A18
Vinculin116
線粒體蛋白Hsp6060
VDCA1/porin31
核蛋白Histone H1/H3 
Lamin B166
PCNA29
TATA binding protein TBP38
HDAC155
細(xì)胞骨架β-actin43
β-tubulin55
α-actin43
α-tubulin55
Cofilin20
血清蛋白Transferrin77

(4)根據(jù)實驗的具體條件選擇,有些實驗條件會對管家基因的表達(dá)有影響而導(dǎo)致部分管家基因不適合做改條件下的內(nèi)參基因,比如于組織缺氧、糖尿病等因素會導(dǎo)致GAPDH的表達(dá)增高,不適合做內(nèi)參,凋亡實驗時,Lamin等也不適合作為內(nèi)參。

(5)根據(jù)樣本類型選擇內(nèi)參,比如做各種分泌液樣本的時候,如血漿、乳汁、組織液等,由于沒有完整的細(xì)胞結(jié)構(gòu),只能選擇一些分泌蛋白作為內(nèi)參。

介紹完了內(nèi)參的選擇,下面我們來介紹下今天的主角GAPDH、β-actin和β-tubulin。這3個WB實驗中內(nèi)參。

1. GAPDH抗體

【GAPDH】甘油醛-3-磷酸脫氫酶,是參與糖酵解的一種關(guān)鍵酶,催化糖酵解的第六步,它還參與核轉(zhuǎn)錄等事件,核糖核酸轉(zhuǎn)錄、DNA復(fù)制和修復(fù)以及細(xì)胞凋亡。由4個30-40 kDa的亞基組成,分子量146kDa,檢測條帶大約在36kDa。GAPDH基因幾乎在所有組織中都高水平表達(dá),廣泛用作WB的內(nèi)參。

2. β-Tubulin抗體

Tubulin即微管蛋白,是細(xì)胞的一種骨架蛋白。Tubulin分為α、β、γ、δ、ε等多種tubulin,其中α-Tubulin和β-Tubulin可以形成異源二聚體,是形成微管的最主要的兩種Tubulin。α-tubulin和β-tubulin分子量分別為55kDa和50kDa,其實際檢測條帶均在55kDa左右。作為內(nèi)參,β-tubulin的蛋白水平通常不會發(fā)生改變,因此被廣泛用于Western Blotting時上樣量是否一致的參照,α-Tubulin和β-Tubulin構(gòu)成微管蛋白的結(jié)構(gòu)也常被用于免疫染色觀察細(xì)胞的微管結(jié)構(gòu)。

3. β-Actin內(nèi)參抗體

Actin即肌動蛋白,是細(xì)胞的一種重要骨架蛋白。Actin大致可分為六種,其中四種是不同肌肉組織特異性的,其余兩種廣泛分布于各種組織中,包括 β-actin和γ-non-muscle actin。β-actin作為內(nèi)參是得到了的,這是針對大多數(shù)組織和細(xì)胞來說的,它廣泛分布于細(xì)胞漿內(nèi),表達(dá)量非常豐富,其含量占所有細(xì)胞總蛋白的50%。但是在一些少量特殊的情況下,如脂肪組織或細(xì)胞β-Actin抗體推薦—高效價的內(nèi)參抗體內(nèi),β-Actin的表達(dá)量就很少。β-actin由375個氨基酸組成,分子量大小為42-43kDa左右。

以上三種內(nèi)參可以滿足80%以上的WB實驗需求,Abbkine推出的通用內(nèi)參抗體雞尾酒,是一種包含了免疫實驗(WB、IHC-P、IF)過程中常用的抗體β-Actin、GAPDH和β-Tubulin以及抗體稀釋液的套裝,并提供了陽性對照,是WB等實驗內(nèi)參的。

產(chǎn)品推薦 : Abbkine 通用內(nèi)參抗體雞尾酒套裝(KTD101-CN)

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